![]() |
產(chǎn)地 | 國內(nèi) |
品牌 | 上海滬崢 |
貨號 | HZS0254 |
用途 | 僅限科研 |
包裝規(guī)格 | 50T/盒 |
純度 | 詳詢客服% |
CAS編號 | |
是否進口 |
產(chǎn)品名稱:
季節(jié)性甲型H1流感病毒檢測試劑盒(實時熒光PCR法)
1.常規(guī)程序
將PCR反應所需的成分配置完后,在PCR儀上于94-96℃預加熱幾十秒至幾分鐘,使模板DNA充分變性,然后進入擴增循環(huán)。在每一個循環(huán)中,先于94℃保持30秒鐘使模板變性,然后將溫度降到復性溫度(一般50-60℃之間),一般保持30秒鐘,使引物與模板充分退火;在72℃保持1分鐘(擴增1kb片段),使引物在模板上延伸,合成DNA,完成一個循環(huán)。重復這樣的循環(huán)25~35次,使擴增的DNA片段大量累積。*后,在72℃保持3-7min,使產(chǎn)物延伸完整,4℃保存。
2.復性(退火)和延伸溫度
復性的溫度是PCR擴增是否順利的關鍵因素,通常在50-60℃之間。具體的溫度主要由引物的Tm值決定。延伸溫度絕大多數(shù)設定為72℃。如果復性的溫度很高,可以將延伸溫度和復性溫度設置成同一溫度,變成二步法PCR。
3.反應時間
變性步驟一般使用30秒鐘,如果模板的G+C含量較高,或直接用細胞做模板,變性時間可適當延長。復性時間有30秒種一般是足夠的。延伸時間由擴增產(chǎn)物的大小決定,一般采用1kb用1分鐘來保證充足的時間。
4.循環(huán)次數(shù)
循環(huán)次數(shù)主要與模板的起始數(shù)量有關,在模板拷貝數(shù)為104~105數(shù)量級時,循環(huán)數(shù)通常為25~35次。
平臺效應(plateaueffect):PCR擴增過程后期會出現(xiàn)的產(chǎn)物的積累按減弱的指數(shù)速率增長的現(xiàn)象。原因:底物和引物的濃度已經(jīng)降低,dNTP和DNA聚合酶的穩(wěn)定性或活性降低,產(chǎn)生的焦磷酸會出現(xiàn)末端產(chǎn)物抑制作用,非特異性產(chǎn)物或引物的二聚體出現(xiàn)非特異性競爭作用,擴增產(chǎn)物自身復性,高濃度擴增產(chǎn)物變性不徹底。
5.PCR反應液的配制
PCR反應體系的配置方式有時也會影響反應的正常進行。常規(guī)方法與其它酶學反應一樣,在*后加入DNA聚合酶。早期的PCR儀沒有帶加熱的蓋子,要求在反應液上覆蓋一層礦物油,防止水分蒸發(fā)。
對于使用具3’-5’外切活性的高溫DNA聚合酶時,有時會擴增不出產(chǎn)物。在遇到這個問題時,如果將反應成分分開配制,A管含模板、引物和dNTP,以及調(diào)整體積的H2O,B管含緩沖液、DNA聚合酶和水,然后再將兩管溶液混合起來,可較好地克服這個問題。
按照常規(guī)的方法配制反應體系,有時會出現(xiàn)非特異性擴增的問題。熱啟動(hotstart)PCR操作方式可較好解決這一問題。將dNTP、緩沖液,Mg2+和primer先配制好,然后加入一粒蠟珠(如AmpliWaxPCRQam100),加熱熔化,再冷卻,使蠟將溶液封住,*后加入模板和DNA聚合酶等剩余成分。只有當PCR反應進入高溫階段后,蠟層熔化,所有反應成分才會混合在一起。
【使用方法】
1. 樣品處理(樣本處理區(qū))
1.1 樣本前處理
組織:取50mg左右組織用玻璃勻漿器勻漿,勻漿后置入潔凈的1.5ml離心管中;
液體標本:取適量標本13000rpm離心2min,棄上清。
1.2 DNA提取
1) 對上述處理好的標本加入40ul 核酸提取液,100℃恒溫處理10分鐘,13,000 rpm離心5分鐘,取上清液轉(zhuǎn)移至新的1.5ml EP管,-20℃保存;
2) DNA的提取也可以采用北京億森寶公司生產(chǎn)的DNA提取試劑盒(離心柱提取法),請嚴格按照試劑盒說明書進行操作。
2. 試劑配制(試劑準備區(qū))
根據(jù)代檢測樣本總數(shù),設所需要的PCR反應管管數(shù)為N(N=樣本數(shù)+1
管陰性對照+1管陽性對照),體系配制如下表:
試劑
WSSV 反應液
酶液
用量(樣本數(shù)為N)
20μl
1μl
3. 加樣(樣本處理區(qū))
將步驟1提取的DNA、陽性質(zhì)控品、陰性質(zhì)控品各取4μl,加入相應的
反應管中,蓋好管蓋,混勻,短暫離心。
4. PCR擴增(核酸擴增區(qū))
4.1 將待檢測反應管置于熒光定量PCR儀反應槽內(nèi);
5. 結果分析判定
結果分析條件設定
設置基線(baseline):一般情況下,對ABI 7500、7700等儀器設為6-15cycle,對PE5700設為3-15cycle,對MJ Research Option2設為6-12cycle。特殊情況可對基線適當調(diào)整。
設置閾值(threshold):以閾值線剛超過陰性對照擴增曲線(無規(guī)則的噪音線)的zui高點。
結果判斷
陽性:檢測樣本Ct值小于等于35.0,且曲線有明顯的指數(shù)增長期;
可疑:檢測樣本Ct值大于35.0且小于40.0,重復一次實驗,如果Ct值仍小于40.0,且曲線有明顯的指數(shù)增長期,為陽性,否則為陰性;
陰性:檢測不到樣本Ct值或Ct值為40。
6. 對檢驗結果的解析
實驗室環(huán)境污染,試劑污染,標本交叉污染會出現(xiàn)假陽性結果;試劑運輸,保存不當或試劑配制不準確引起的試劑檢測效能下降,出現(xiàn)假陰性或定量檢測不準確的結果。
7. 質(zhì)控標準
陰性質(zhì)控品:擴增曲線無對數(shù)生長期或無Ct值顯示;
陽性質(zhì)控品:擴增曲線有明顯對數(shù)生長期,且Ct值≤32;
以上條件應同時滿足,否則實驗視為無效。
季節(jié)性甲型H1流感病毒檢測試劑盒(實時熒光PCR法)需要自備的器材:
1.儀器:分析天平、離心機、熒光 PCR 擴增儀、組織研磨器、-20 ℃冰箱、可調(diào)移液器(2 μL、20μL、200 μL、1000 μL)。
2.耗材:熒光 PCR 專用反應管、眼科剪、眼科鑷、生理鹽水、1.5 mL 經(jīng)焦碳酸二乙酯(DEPC)水處理的滅菌離心管、吸頭(10 μL、200 μL、1000 μL)、滅菌雙蒸水。
季節(jié)性甲型H1流感病毒檢測試劑盒(實時熒光法)1.模板制備(樣本制備區(qū))
建議使用配套水生動物病毒基因組DNA/RNA提取試劑盒系列產(chǎn)品,具體過程詳見產(chǎn)品說明書。
2.添加模板(模板添加區(qū),放置于冰盒上進行)
剪下所需測試數(shù)的已含有反應液的PCR管,放置在室溫待解凍后,離心30秒后揭開封口膜,向每管反應液中分別加入5μL模板,順序為NG、待測樣品模板、PG-VH-P。蓋好配套的PCR管蓋后,渦旋混勻30s,離心1min,立即進行PCR擴增反應。
3. 擴增反應(擴增及產(chǎn)物分析區(qū))
使用熒光定量PCR儀,熒光基團選擇FAM,淬滅基團選擇TAMRA。